Enable to parse the files.Error in the following command: for seq_record in SeqIO.parse("sequence.fasta","fasta"): ...: print(seq_record.id)
The parse files doesn't open even if the file name is same and saved in dekstop,documents and python program files.
In the first 2 videos of biopython I didn't face any error. But in the 3rd video of parsing data the commands are not working and showing error. Could you please help me to resolve this problem? Thank you
In [2]: from Bio import SeqIOIn [3]: for seq_record in SeqIO.parse("sequence.fasta", "fasta"): ...: print(seq_record.id)------------------------------------------------------------IndentationError: expected an indented block (<ipython console>, line 2)In [4]:
error in the following command: print(seq_record.id)
How to open text file in windows os? instead of text editor shall i use loadtxt command
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Outline:NCBI डेटाबेस वेबसाइट से FASTA और GenBank फाइल्स डाउनलोड करना Bio.SeqIO मोड्यूल में फंक्शन्स उपयोग करके डेटा फाइल्स पार्स करना पार्स फंक्शन (Bio.SeqIO. Parse()) उपयोग करके जानकारी जैसे कि सीक्वेंस id’s, फाइल में रहने वाली सीक्वेंस और सीक्वेंस की लम्बाई एक्सट्रेक्ट करना सिंगल रेकॉर्ड के साथ डेटा फाइल से विषय वस्तुओं को पढ़ने के लिए रीड फंक्शन (Bio.SeqIO.read()) उपयोग करना
NCBI डेटाबेस वेबसाइट से FASTA और GenBank फाइल्स डाउनलोड करना Bio.SeqIO मोड्यूल में फंक्शन्स उपयोग करके डेटा फाइल्स पार्स करना पार्स फंक्शन (Bio.SeqIO. Parse()) उपयोग करके जानकारी जैसे कि सीक्वेंस id’s, फाइल में रहने वाली सीक्वेंस और सीक्वेंस की लम्बाई एक्सट्रेक्ट करना सिंगल रेकॉर्ड के साथ डेटा फाइल से विषय वस्तुओं को पढ़ने के लिए रीड फंक्शन (Bio.SeqIO.read()) उपयोग करना
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