whenever i try to fix hydrogen and minimize, hydrogen adds only in the backbone of protein structure. the oxygen molecules that present beside the protein does not get the hydrogen molecule. i tried it other pdb files, but there is same issue. is it a malfunction? give me suitable solution.
In Jmol version 14.31.2, hydrogen is not getting added after clicking on “add hydrogen” option from the model kit menu. How to add the hydrogen atoms to the molecule?
In Jmol version 14.31.2, the code file provided for human insulin opens in cartoon style. How do I get the same display style as shown in video?
130 visits
Outline:ପ୍ରୋଟିନ୍ ଡେଟା ବ୍ୟାଙ୍କରୁ ପ୍ରୋଟିନର ଷ୍ଟ୍ରକଚରଗୁଡିକୁ ଲୋଡ୍ କରିବା ଡେଟାବେସରୁ .pdb ଫାଇଲଗୁଡିକୁ ଡାଉନଲୋଡ୍ କରିବା PDB କୋଡ୍ (4EX1)କୁ ବ୍ୟବହାର କରି Insulinର 3D ଷ୍ଟ୍ରକଚରକୁ ଦେଖିବା ବିନା ୱାଟର୍ ମଲିକ୍ୟୁଲରେ ଷ୍ଟ୍ରକଚରକୁ ଦେଖିବା ସେକେଣ୍ଡାରୀ ଷ୍ଟ୍ରକଚରର ପ୍ରଦର୍ଶନକୁ ରୂପାନ୍ତର କରିବା hydrogen ଓ disulfide ବନ୍ଧଗୁଡିକୁ ହାଇଲାଇଟ୍ କରିବା
ପ୍ରୋଟିନ୍ ଡେଟା ବ୍ୟାଙ୍କରୁ ପ୍ରୋଟିନର ଷ୍ଟ୍ରକଚରଗୁଡିକୁ ଲୋଡ୍ କରିବା ଡେଟାବେସରୁ .pdb ଫାଇଲଗୁଡିକୁ ଡାଉନଲୋଡ୍ କରିବା PDB କୋଡ୍ (4EX1)କୁ ବ୍ୟବହାର କରି Insulinର 3D ଷ୍ଟ୍ରକଚରକୁ ଦେଖିବା ବିନା ୱାଟର୍ ମଲିକ୍ୟୁଲରେ ଷ୍ଟ୍ରକଚରକୁ ଦେଖିବା ସେକେଣ୍ଡାରୀ ଷ୍ଟ୍ରକଚରର ପ୍ରଦର୍ଶନକୁ ରୂପାନ୍ତର କରିବା hydrogen ଓ disulfide ବନ୍ଧଗୁଡିକୁ ହାଇଲାଇଟ୍ କରିବା
Show video info
Pre-requisite