The Tutorials in this series are created using Jmol 12.2.2 Jmol v 14.32.80 on Ubuntu 12.04, Ubuntu Linux OS v 20.04. Jmol is an open-source Java viewer for chemical structures and biomolecules in 3D. It does not require 3D acceleration plugins. 3D models created by using Jmol may be used as a teaching tool or for research in chemistry and biochemistry. It is free and open source software, written in Java, it runs on Windows, Mac OS X, Linux and Unix systems. Read more
Foss : Jmol Application - Punjabi
Outline: ਮਾਡਲ ਨੂੰ ਰੋਟੇਟ, ਜ਼ੂਮ, ਮੂਵ ਅਤੇ ਸਪਿਨ ਕਰਨਾ। ਵਿਊ ਨੂੰ ਬਦਲਣਾ। ਡਿਸਪਲੇ ਦਾ ਸਟਾਈਲ ਬਦਲਣਾ। ਐਟਮਸ ਅਤੇ ਬੌਂਡਸ ਦਾ ਸਾਈਜ ਅਤੇ ਰੰਗ ਬਦਲਣਾ। ਐਕਸਸ ਅਤੇ ਬਾਉਂਡ ਬਾਕਸl ਵੱਖ-ਵੱਖ..
Outline: Carboxylic ਐਸਿਡ ਦਾ ਇੱਕ ਮਾਡਲ ਬਣਾਉਣਾ, ਉਦਾਹਰਣ: ਅਸੈਟਿਕ ਐਸਿਡ । Nitroalkane ਦਾ ਇੱਕ ਮਾਡਲ ਬਣਾਉਣਾ, ਉਦਾਹਰਣ: ਨਾਇਟਰੋਇਥੇਨ । ਇੱਕ ਮਾਡਲ ਵਿੱਚ ਐਟਮਸ ਨੂੰ ਐਲੀਮੈਂਟ ਦੇ ਸਿੰਬਲ ਨਾਲ ਲੇਬਲ ਕਰਨਾ। ਇ..
Outline: ਸਕਰਿਪਟ ਕਮਾਂਡਾਂ ਦੇ ਬਾਰੇ ਵਿੱਚ। ਸਕਰਿਪਟ ਕਮਾਂਡਾਂ ਕਿਵੇਂ ਲਿਖਦੇ ਹਨ। ਸਕਰਿਪਟ ਕੰਸੋਲ ਦੀ ਕਿਵੇਂ ਵਰਤੋ ਕਰਦੇ ਹਨ । ਸਕਰਿਪਟ ਕਮਾਂਡਾਂ ਪ੍ਰਯੋਗ ਕਰਕੇ ਪ੍ਰੋਪੇਨ ਦਾ ਡਿਸਪਲੇ ਬਦਲਣਾ। ਐਟਮਸ ਅਤੇ ਬੌਂਡਸ ਦਾ ..
Outline: Alicyclic ਮੌਲੀਕਿਊਲਸ ਦੇ ਮਾਡਲ ਬਣਾਉਣਾ। ਉਦਾਹਰਣ: ਸਾਇਕਲੋਹੈਕਸੇਨ। Aromatic ਮੌਲੀਕਿਊਲਸ ਦੇ ਮਾਡਲ ਬਣਾਉਣਾ। ਉਦਾਹਰਣ: ਬੈਂਜੀਨ । ਮੌਲੀਕਿਊਲਸ ਦੀ ਸਰਫੇਸ ਟੋਪੋਲਜੀ ਦਿਖਾਉਣਾ। ਉਦਾਹਰਣ: ਮੌਲੀਕਿਊਲਰ ਸਰਫੇਸ ਅਤੇ ..
Outline: ਰਸਾਇਣਕ ਸਟਰਕਚਰ ਡੇਟਾਬੇਸ (PubChem) ਵਿਚੋਂ ਰਸਾਇਣਕ ਸਟਰਕਚਰਸ ਲੋਡ ਕਰਨਾ। ਫਿਨੋਲ ਦਾ ਸਟਰਕਚਰ ਲੋਡ ਕਰਨਾ ਅਤੇ ਇਸਨੂੰ ਪੈਰਾ-ਅਮੀਨੋ ਫਿਨੋਲ ਵਿੱਚ ਬਦਲਨਾ। ਕੋਲੈਸਟਰੋਲ ਦਾ ਸਟਰਕਚਰ ਲੋਡ ਕਰਨਾ ਅਤੇ ਡਬਲ-ਬੌਂਡ ਅਤੇ ਸ..
Outline: * ਕਰਿਸਟਲੋਗਰਾਫੀ ਓਪਨ ਡਾਟਾਬੇਸ ਤੋਂ CIF (Crystallographic Information File) ਡਾਊਂਨਲੋਡ ਕਰਨਾ * Jmol ਵਿੱਚ CIF ਫਾਇਲਸ ਨੂੰ ਖੋਲ੍ਹਣਾ । * ਪੈਨਲ ‘ਤੇ ਯੂਨਿਟ ਸੈੱਲ ਅਤੇ ਯੂਨਿਟ ਸੈੱਲ ਪੈਰਾਮੀਟਰਸ ਨੂੰ ਦਿ..
Outline: ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਡੇਟਾ ਬੈਂਕ (PDB ) ਵਿਚੋਂ ਪ੍ਰੋਟੀਂਸ ਦਾ ਸਟਰਕਚਰ ਲੋਡ ਕਰਨਾ। ਡੇਟਾਬੇਸ ਵਿਚੋਂ .pdb ਫਾਈਲਾਂ ਡਾਊਨਲੋਡ ਕਰਨਾ। PDB ਕੋਡ (4EX1) ਪ੍ਰਯੋਗ ਕਰਕੇ ਇੰਸੁਲੀਨ ਦਾ 3D ਸਟਰਕਚਰ ਵੇਖਣਾ। ਪਾਣੀ ਦੇ ਮੌਲੀਕਿ..
Outline: PDB ਕੋਡ ਪ੍ਰਯੋਗ ਕਰਕੇ ਹੈਕਸੋਕਾਇਨੇਜ਼ (Hexokinase) ਦਾ ਸਟਰਕਚਰ ਲੋਡ ਕਰਨਾ। ਸਕੈਂਡਰੀ ਸਟਰਕਚਰ ਦੇ ਡਿਸਪਲੇ ਨੂੰ ਬਦਲਣਾ। ਸਰਗਰਮ ਸਾਈਟ ਉੱਤੇ ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ ਰੈਸੀਡਿਊਜ਼ ਨੂੰ ਹਾਈਲਾਈਟ ਕਰਨਾ। ਸਬਸਟਰੇਟ ਨੂੰ ਹ..
Outline: 1. ਮੀਥੇਨ ਮੌਲੀਕਿਊਲ ਵਿੱਚ ਐਟਮਸ ਦੇ ਮਾਧਿਅਮ ਦੁਆਰਾ (C2 ਅਤੇ C3 ਰੋਟੇਸ਼ਨਲ ਐਕਸਸ) ਲਾਈਨਾਂ ਬਣਾਉਣਾ। 2. ਐਕਸਿਸ ਉੱਪਰ ਮੌਲੀਕਿਊਲ ਨੂੰ ਸਪਿਨ ਕਰਨਾ ਅਤੇ ਘੁੰਮਾਉਣਾ। 3. ਮੀਥੇਨ ਮੌਲੀਕਿਊਲ ਵਿੱਚ ਐਟਮਸ ਦੇ ਮਾਧਿਅਮ ਦ..
Outline: Jmol animation using script commands. ਉਦਾਹਰਣਾਂ ਦੀ ਤਰ੍ਹਾਂ ਇਥੇਨ ਅਤੇ ਹੀਮੋਗਲੋਬਿਨ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਕੇ ਐਨੀਮੇਸ਼ਨ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਣਾ । move, delay, slab, loop ਅਤੇ capture ਕੀਵਰਡਸ ਦੇ ਨਾਲ ਸਕਰਿਪਟ ਕਮ..
Foss : Jmol Application - Tamil
Outline: Jmol அப்ளிகேஷன் பற்றிய சுருக்கமான விளக்கம். மென்பொருள் தேவைகள். முன்நிபந்தனைகள். உபுண்டு/ லினக்ஸ் இயங்குதளத்தில் Jmol அப்ளிகேஷனைத் திறத்தல். ப்ரோகிராம் இடைமுகத்தை விளக்குதல் (..
Outline: மூலக்கூறு மாதிரியில் ஹைட்ரஜனுக்கு பதிலாக செயல்பாட்டு குழுவை சேர்த்தல். பிணைப்புகளை சேர்த்தல் மற்றும் நீக்குதல். அணுக்களை சேர்த்தல் மற்றும் நீக்குதல். Pop-up-menu (Contextual me..
Outline: மாதிரியை சுழற்றுதல், பெரிதாக்குதல், நகர்த்துதல் மற்றும் spin செய்தல் View ஐ மாற்றுதல் Display ன் style ஐ மாற்றுதல். அணுக்கள் மற்றும் பிணைப்புகளின் நிறம் மற்றும் அளவை மாற்றுதல் ..
Outline: ஒரு கார்பாக்சிலிக் அமில மாதிரியை உருவாக்குதல். உதாரணம், அசிட்டிக் அமிலம். ஒரு நைட்ரோஅல்கேனின் மாதிரியை உருவாக்குதல். உதாரணம், நைட்ரோஈத்தேன். ஒரு மாதிரியில் அணுக்களுக்கு தனிமத்தின..
Outline: Script Commandகள். Script commandகளை எவ்வாறு எழுதுவது. Script console ஐ எவ்வாறு பயன்படுத்துவது. Script commandகளை பயன்படுத்தி ப்ரோப்பேனின் display ஐ மாற்றுவது. அணுக்கள் மற்றும்..
Outline: அலிசைக்ளிக் (alicyclic) மூலக்கூறுகளின் மாதிரிகளை உருவாக்குதல். உதாரணம்: சைக்ளோஹெக்சேன் (Cyclohexane). அரோமேடிக் (aromatic) மூலக்கூறுகளின் மாதிரிகளை உருவாக்குதல். உதாரணம்: பென்சீன்..
Outline: வேதியியல் அமைப்பு தரவுத்தளத்திலிருந்து (PubChem) வேதியியல் அமைப்புகளை ஏற்றுதல். ஃபீனாலின் அமைப்பை ஏற்றி அதை பாரா-அமினோ ஃபீனாலாக (Para-amino Phenol) மாற்றுதல். கொலஸ்ட்ராலின் (ch..
Outline: * Crystallography Open Database(COD)ல் இருந்து, CIF(Crystallographic Information File)ஐ download செய்வது. * Jmolலில், CIF fileகளை திறப்பது. ..
Outline: Protein Data Bank (PDB) லிருந்து புரதங்களின் அமைப்புகளை ஏற்றுதல். தரவுத்தளத்திலிருந்து .pdb fileகளை தரவிறக்குதல். PDB code (4EX1) ஐ பயன்படுத்தி இன்சுலினின் முப்பரிமாண அமைப்பை கா..
Outline: PDB codeஐ பயன்படுத்தி, Hexokinaseன் structure ஐ load செய்வது. Secondary structureன் displayஐ மாற்றவது. Active siteல், amino acid residueக்களை முன்னிலைப்படுத்து..